La Secretaría de Desarrollo Social, distribuye el FAIS entre los Estados y la CDMX, conforme a una fórmula que considera el número de carencias de la población en condiciones de vulnerabilidad, la población en pobreza extrema y los resultados en disminuir estas características.

EL FAIS se divide en dos Fondos.

El Fondo de Infraestructura Social para las Entidades (FISE), el cual es ejercido directamente por los Gobiernos de las Entidades Federativas, y que equivale aproximadamente al 12%, y


El Fondo de Aportaciones para la Infraestructura Social Municipal y de las Demarcaciones Territoriales del Distrito Federal (FISMDF), el cual es aplicado por los Gobiernos de los Municipios y las Demarcaciones Territoriales, y que representa casi el 88% del FAIS.